A felnőtt csapat 2019 tavaszán jutott a második vonalba, de a bemutatkozó idénye a Covid-19 okozta világjárvány miatt félbeszakadt. A módosított bajnoki rendszerben zajló 2020/21-es kiírás során az FK Csíkszereda a felsőházi rájátszásba küzdötte megát és végül az ötödik helyen végzett. A 2021/22-es idényben már nem jött ki a lépés, a csapat rosszabb gólkülönbséggel maradt le a felsőházról, így – a húsz csapatos mezőnyben – hetedik lett. A 2022/23-as idényben immáron az élvonalba jutás a cél.
